เมื่อเวลา 18.43 น. วันที่ 30 มีนาคม ศูนย์วิทยุ 191 สภ.พุนพิน จ.สุราษฎร์ธานี รับแจ้งเหตุขบวนรถไฟด่วนพิเศษ 44 (สปรินเตอร์) สุราษฎร์ธานี-กรุงเทพอภิวัฒน์ ชนรถกระบะ บริเวณจุดตัดทางลักผ่าน ระหว่างสถานีชุมทางบ้านทุ่งโพธิ์-มะลวน หมู่ 7 ต.หัวเตย อ.พุนพิน มีผู้บาดเจ็บติดอยู่ในรถกระบะ จึงแจ้งพนักงานสอบสวน ประสานขอสนับสนุนกู้ภัยมูลนิธิกุศลศรัทธาสุราษฎร์ธานีนำอุปกรณ์เครื่องตัดถ่างให้การช่วยเหลือ ที่เกิดเหตุอยู่ห่างจุดตัดประมาณ 30 เมตร

พบหัวขบวนรถไฟชนอัดก๊อบปี้รถกระบะยี่ห้อโตโยต้า แบบตอนครึ่ง สีบรอนซ์เงิน ทะเบียนสุราษฎร์ธานี ด้านหน้ารถกระบะสภาพพังยับเยิน เจ้าหน้าที่ใช้เครื่องตัดถ่างนำร่างผู้เสียชีวิต 2 ราย และผู้บาดเจ็บ 3 ราย ส่งโรงพยาบาลพุนพิน โดยขบวนรถไฟออกจากที่เกิดเหตุเวลา 20.21 น. เดินทางต่อไปได้แล้ว ซึ่งล่าช้าไป 128 นาที

ถึงที่เกิดเหตุจุดตัดทางรถไฟมะลวน ได้มีรถยนต์หลายคันพยายามเร่งข้ามทางรถไฟ จนกระทั่งมาถึงรถกระบะคันเกิดเหตุดังกล่าวข้ามไม่พ้น ถูกขบวนรถไฟพุ่งชนอย่างจังและลากไปประมาณ 30 เมตร ส่วนสาเหตุอยู่ระหว่างการสอบสวนข้อเท็จจริงต่อไป พนักงานขับรถไฟเล่าว่า

ขบวนรถไฟออกจากต้นทางสถานีสุราษฎร์ธานี เวลา 18.25 น. เมื่อมาถึงจุดดังกล่าวซึ่งเป็นจุดลักผ่าน ทางการรถไฟแห่งประเทศไทยไม่ได้อนุญาตให้เป็นจุดตัด พบรถกระบะอยู่ด้านหน้ารถคันเกิดเหตุประมาณ 3 คันได้ขับผ่านไป จนมาถึงคันเกิดเหตุ ตนกดส่งสัญญาณเตือนแล้ว กระทั่งพุ่งชนรถกระบะเข้าอย่างจัง ซึ่งในตอนนั้นรถไฟไม่ได้มาเร็ว แต่ก็ไม่สามารถหยุดรถไฟกะทันหันได้